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O Atol das Rocas, juntamente com o Arquipélago de Fernando de Noronha, é considerada a área mais importante para a reprodução de aves marinhas no Brasil, tanto em diversidade como em número de indivíduos. O Atol, porém, é também utilizado por outras espécies marinhas, migratórias e visitantes esporádicas, para o descanso e forrageio.